Fotografar com ISO alto continua sendo um problema na cabeça das pessoas.
Não é tão grave assim, exceto quando usado nos extremos.
Fotos com ISO alto causam mais problemas quando a luz existente é muito baixa, aparecendo o famoso chroma noise, que é causado pelo software da câmera tentando "advinhar" o que não existe, pois sem a luz não existe imagem mesmo.
Fotografar com ISOs mais altos com luz razoável é salutar e mesmo com o uso do flash (geralmente rebatido). É possível deixar imagens mais naturais e com o fundo mais iluminado, ao invés daquelas imagens com o primeiro plano bem exposto e o fundo escuro.
Para controlar o ruído podemos usar alguns programas como o LR. Por sinal, um amigo fotógrafo está conseguindo trabalhar com uma D90 em ISOs acima de 1600, até mesmo 2500 tratando com LR e obtendo resultados impressionantes.