Primeiro, realmente é muito importante ver a reputação das marcas quanto à assistência. Muita gente não faz isso e se dá mal depois.
A Nikon no Brasil vende quase que somente câmeras, então ter muita reclamação é um problema. E isso não é só no Brasil; a Nikon tem fama de ter assistência ruim no mundo todo, basta ver que só recentemente ela se pronunciou quanto a um problema bastante conhecido de todos, da graxa no sensor da D600. As câmeras são ótimas, mas conseguir assistência é complicado.
Já a Canon é uma empresa muito maior, então tem problema de todo tipo ali: impressora, cartucho, câmera, etc. E tem reclamação que nem é reclamação, é mimimi porque a impressora é barata mas o cartucho é caro... Sobre o que interessa aqui no fórum, não tenho experiências com a assistência da Canon.