Depende das pilhas, né? Boas pilhas têm excelente durabilidade, e dependendo, até aguentam mais fotos do que a bateria. Pilhas (inclusive as boas) são mais baratas do que baterias extras. E numa emergência, em qualquer canto vc encontra alcalinas pra te socorrer. Enfim, não consigo ver qualquer desvantagem em pilhas. Muito pelo contrário... Se me apresentassem as mesmas câmeras, uma com pilha e outra com bateria, eu ficaria com as de pilha.
Quando eu disse "não duram" eu me referi a vida útil delas, não a quantas fotos ela "aguenta" tirar. Já tive diversas marcas de pilhas regarregáveis e com o tempo elas vão perdendo sua capacidade de recarga, ou seja, vc carrega e depois eles não "aguentam" muito tempo na máquina.
Mas, pra mim, a principal desvantagem seria o custo mesmo, ter de comprar carregador pilhas..etc Se bem que as pilhas AA baratearam muito por causa das AAA.
Quando eu tinha uma reflex Canon EOS 5000 kit ( filme ) na década de 90 eu utilizava um "dispensa bateria" que utilizava 4 pilhas aa e naquela época era mais vantajoso...