Olha, acredito que possa ser algum problema com a lente então. Não sei com que versão da 50mm fixa vc está comparando, mas se for a 1.8 não STM, ela não é mais lenta mesmo !!
Alguns exemplos de fotos de objetos em movimento feitas com ela.
Objeto vindo em sentido contrário
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Objeto movendo-se lateralmente, com o foco acompanhando em AI-SERVO
E também já tirei foto de skatistas, pássaros, aviões e outros objetos em movimento. Enfim, como falei não é um primor de velocidade, mas não deixa a desejar em um uso mais "normal". Existe uma perda por erro de foco, mas é bem baixa, aumentando quando as condições de luminosidade pioram. Claro que se vc está focando no infinito e de repente quer fotografar algo próximo, ela é (bem) mais lenta que uma lente TOP.
Sou da opinião do Lindsay, eu tentaria experimentar outra unidade ou levar em algum técnico.