Existe algumas diferenças entre as imagens produzidas pelas câmeras que vc citou, além da questão FF e crop, a 6D tem imagens mais quentes e com cores diferentes da 5D2. São diferenças estéticas, de cores, ruído (ISO) e sistema de foco, que em minha opinião é mais esperto na 6D, principalmente com lentes mais modernas.
A 24-70 L f/2.8 faz um ótimo conjunto com um corpo FF, tanto a antiga como a nova são lentes de uso geral maravilhosas, porem seria mais limitado em GA com cropadas.
Minha escolha seria 6D com a 24-70mm, mas recomendo tbm considerar duas ou 3 lentes fixas, mais leves e com boa abertura ao invés de comprar a pesadíssima e enorme 24-70.