Amigo, não estou usando os flash's sincronizados, trabalho com duas câmeras e uso um em cada câmera, na grande maioria das vezes rebatido.
E acontece justamente o contrario, as fotos estouram se eu deixar a compensação de exposição em 0, geralmente tenho que trabalhar em -1 / -2 dependendo da cena.
Já li e reli o manual do SB700, já tentei várias configurações, e raramente ele acerta a exposição com a compensação cravada.
Já pensei até na possibilidade do flash estar com algum defeito, mas ainda não tive a oportunidade de testar outro.
A Nikon tem uma coisa enjoadinha: ela tem um controle de exposição na câmera (o botãozinho do flash) que regula o volume de exposição total do conjunto (para facilitar o ajuste de exposição total conservando o ratio que você já determinou quando utiliza mais de um flash, visa facilitar, mas se não prestar atenção faz uma confusão infernal porque tem outro no flash, que quando está em cima da sapata, sozinho, acaba servindo para a mesma coisa...
Se passar despercebido um incremento ou uma redução na compensação de exposição do flash e você optar apenas por corrigir na compensação sem buscar onde está o erro, vai ficar trabalhando sempre com ajustes que parecem completamente sem sentido.
Estou falando isso porque fui convidado a dar uma palestra na Abaf (pelo Clube Rio Fotográfico), esse assunto veio à discussão, e alguns dos que estavam presentes me questionaram sobre a precisão de exposição dos flashes da Nikon, por sorte dois deles estavam com suas câmeras e flashes e foi exatamente isso o que encontrei.
Fora isso, para que Nikon superexponha, das vezes que ocorreu comigo era mau contato na sapata, suja, engordurada ou erro no ajuste da exposição da cena... Notei que nessas fotos até o WB as câmeras erram, puxando para um color cast de magenta, mas nem sempre.
Outra coisa que é importante considerar é a lente que está usando, é Nikon? É "D"? Isso acontece sempre com essa lente ou acontece também com outras lentes? Pode ser uma lente defeituosa mandando informação incorreta para a câmera, faça uma foto com uma distância determinada, tipo, 3 metros, depois abra a imagem e confira a informação no Exif.
Usei uma D700, lente 85 1.4, e dois SB'900 tudo tempo todo em TTL, só ajustando na compensação o nível de luz que eu desejava para cada flash dependendo da sua posição. Ainda nem editei (vai ver que aparece sujeira, bolsa de equipamentos, e mais umas tranqueiras em algumas fotos).
Essa aqui eu fiz com uma 20 3.5 AIS (manual, que não informa a distância à câmera).