N~sao é bem assim, Renato.
Voc~e baixa pelo Viewer. Mas depois disso abandona o programa da Fuji. A partir da hora em que seu RAW está no micro, trate-o com os programas de conversão de RAW bons. Pode ser o Adobe Camera RAW que é um plugin do Photoshop, pode ser o SilyPix, pode ser o Adobe Lightroom Beta ou ainda o programa s7RAW específico para as Fujis.
Esses programas permitem que a etapa de controle de luzes, contraste, etc seja feito neles, voc~e faz isso e quando converte para tiff já converte do jeito desejado, bastando pequeníssimos ajustes posteriores. Quanto mais você puder fazer os ajustes na conversão, melhor.
O programa de Fuji é muito ruim. A única vantegem dele é produzir uma imagem igual ao JPEG mas sem os artifacts da supercompressão que a Fuji usa. Mas nesses outros não, nesses você tem o controle mesmo.