Migrei da Sony pra Fuji ano passado porque o lineup de lentes APS-C pra Sony é medíocre. Creio que eles estão investindo na linha full frame na ideia de que seja um caminho de migração, mas era algo que não me interessava.
Li uma resposta no início do tópico dizendo que um sistema Fuji vai ficar muito mais caro que um sistema DSLR. Fica se você comprar uma X-T2 com 3 lentes top de linha e comparar isso com uma DSLRzinha plástica de entrada com uma lente de kit, claro. Comparando maçãs à maçãs e laranjas à laranjas, o custo não é muito diferente e possivelmente inferior com o sistema Fuji.
Claro, isso vai depender muito do que você quer fazer com ele, o tipo de trabalho que faz e os equipamentos que precisa. Se precisar de lentes como a 16-55mm f2.8 e a 50-140mm f2.8, aí vai ficar uma bolada mesmo, mas isso vale pra qualquer outro sistema (Canon, Nikon, Sony etc).
Você pode pegar uma super-compacta como a X-E ou uma X-T10 com uma lente de kit 18-55 f2.8-4 e talvez uma prime clara como a 35mm f2 e ser muito feliz. É um kit leve e relativamente "barato" (pro mundo da fotografia não-point&shoot).
Sobre o preço das lentes, galera que fala que é mais cara também não faz comparação justa, em geral. Por exemplo, a lente de kit da Fuji é a 18-55 f2.8-4, feita no Japão, praticamente toda de metal, com estabilização de imagem da Fuji que é um dos melhores (eles fazem binóculos estabilizados pra uso em helicópteros, NASA e o escambau). Aí vão e comparam com as kits plásticas chinesas 18-55 f3.5-5.6 de outras marcas. Sim, custa mais $$, mas você está pagando por algo bem melhor (dá uma lida nos reviews das 18-55 de Canon, Nikon, Sony e Fuji pra ver a diferença). É comparar um Fiat Uno basicão com um quatro-portas, com ar condicionado e teto-solar (nem sei se existe hahaha).
Enfim, não estou dizendo que as outras marcas não tem câmeras e lentes ótimas, porque todas tem. Inclusive no sistema Canon e Nikon tem muito mais, pois existem há muito mais tempo e há outros fabricantes (Sigma, Tokina, Tamron etc) fazendo ótimas lentes, coisa que na Fuji ainda não existe (são 3 lentes da Zeiss e mais umas 5 manuais da Rokinon e só). A concorrência tende a ajudar a baixar os preços também, embora no mercado fotográfico isso nem sempre aconteça.
Outra coisa importante: hoje em dia todos esses sistemas são ótimos. Vejo muita gente debatendo sobre isso e é besteira. Com prática, dedicação e boa ténica, um equipamento mid ou top-end de qualqer dessas marcas (Canon, Nikon, Sony, Fuji, Olympus, Panasonic... Leica
) vai produzir excelentes resultados, e a grande maioria das pessoas (incluindo fotógrafos) olhando pro trabalho final não vai saber dizer qual marca de equipamento foi usado... e nem liga pra isso na verdade. Se puder testar na sua mão os equipamentos cujas especificações te interessam, faça isso. Veja qual você gosta mais de usar, os controles, ergonomia do corpo e lentes. Compre e vá estudar e praticar técnica.
Óbvio, se você for tirar fotos de esportes profissionais ou animais selvagens pra NatGeo e precisa de uma lente de 1 bilhão de mm, vai ter que ser Canon ou Nikon. Mas, fora isso, todas fazem o trabalho.