Bem, se a câmera é uma dslr com visor ótico de verdade, a troca da tela de foco original por uma com split/microprisma não afeta o sistema de foco automático, mas pode causar alguns inconvenientes, quase todos contornáveis.
O mais frequente é causado pela variação na fotometria, pois existem telas de foco mais e menos claras. Por isso algumas câmeras tem nas configurações uma opção na qual você informa o tipo de tela. Mas você pode perfeitamente aplicar uma compensação de exposição para mais ou para menos. Geralmente esse valor é na faixa de +/- meio ponto, mas pode chegar a 1 ponto.
O segundo problema é mais enjoado. As marcações gravadas na tela de foco podem ser diferentes, por exemplo o tamanho do spot, ou podem até estarem ausentes, como no caso dos pontos de foco. Algumas câmeras iluminavam diretamente essas gravações onde estavam os pontos de foco, e outras tinham uma segunda tela 100% transparente para tal, o que mantinha a iluminação dos pontos funcionando perfeitamente. Por exemplo a 5D tem a segunda tela e a 350D não tem.
O terceiro problema é que existem telas com finalidades muito diferentes. Algumas, feitas para GA e UGA tem compensação para o chamado light falloff nas bordas (escurecimento), outras não. Então uma tela de má qualidade apresentará bordas bem mais escuras quando uma UGA estiver sendo usada.
A explicação de por que não afeta o AF se for uma SLR verdadeira é simples. O sistema de AF nas SLR (quando pelo OVF) é composto pelo espelho principal, que é na verdade um semi-espelho (pelo menos no centro), e o sensor de AF é posicionado por trás do espelho. As vezes o sensor fica diretamente sob o espelho e outras, na base da caixa do espelho (5D por exemplo). Quando é na base, existe um espelho secundário que desvia a imagem para o sensor de AF.
https://www.reikanfocal.com/about-autofocus.html
