Minha primeira Fuji foi uma X-A1, que não tinha X-Trans. Apesar disso, o sensor era bastante elogiado, especialmente em alto ISO.
Até onde sei, o X-Trans serve pra abolir o uso de filtro Antialias (anti-sobreposição?) em sensores de relativamente baixa resolução. Com a resolução dos sensores atuais aumentando tanto, este filtro começa a ser desnecessário mesmo em sensores Bayer comuns. Então faria algum sentido não haver mais esta necessidade.
Finalmente, com sensor Bayer, finalmente poderíamos ter DxO pra Fuji.
Seria bem lógico o uso de Bayer - as XT-100 e XT-200 eram Bayer, e o alto ISO delas era considerado até melhor que as X-Trans.
Mas...na comunidade Fuji X o X-Trans é considerado um asset importante da "filosofia", então o backlash poderia ser forte.