Mac,
Eu acho que é o seguinte: (acho, o Pictus com certeza pode dizer com mais certeza):
Merge visible = junta somente o que está visível sem perder transparência.
Então: Naquela caixa que mostra as layers, se vc reparar, do lado do Thumb que mostra a layer, tem um "olhozinho", se vc passar o mouse por cima desse "olhozinho", vai aparecer "Incicates layer visibillity".
Suponha que vc esta fazendo um trabalho que tenha 4 layers, e vc quer juntar apenas 2 e deixar as outras 2 como estão. Então vc deve desmarcar as que vc não quer juntar, clicando nesses "olhozinhos". Assim dicarão viziveis apenas as layers que vc deixou marcados. Aí então, usando o Merge Visible, vc vai juntar apenas essas layers que estavam marcadas, e as que estavam desmarcadas vão continuar sendo layers separadas. Feito isso, marque as outras layers novamente pra que fiquem visiveis.
Me corrijam se eu estiver falando bobagem...
abraços!! :thmbup: