Usei o termo filtro, no sentido de algo que remove algo indesejado.
Esse filtro eo software que roda na camera, vamos fazer um exemplo numerico para entender isso.
Um pixel do ccd (não da imagem), mediu numa exposição normal 100ua,
A exposição de referência (aquela feita no escuro), mediu 10ua.
A diferença entre eles e 90ua, esse vai ser o valor desse pixel no raw final, que vai ser convertido pelo software da camera para jpg ou tiif.
Na prática a coisa e mais complicada que isso, deve envolver uma analize estatistica da distribuição dos pixels, etc...
ua -> Unidade Arbitraria.
Veja que esse metodo tenta ao máximo não destruir a informação captada, versões super sofisticadas desse metodo são usando em camera DSLR, principalemente as que usam sensores CMOS.
E, esse software pode não fazer parte do software da camera, e sim estar inscrustada direto na pastilha onde o sensor esta presente, por isso acima chamei de hardware.
Já reparou que, quando faz uma foto de loga exposição, a camera demora mais tempo para mostrar a imagem? (e esse filtro em ação, mais outros tratamentos)
Tratamento/Filtro de ruido e algo bem polemico e complexo (não so em fotografia), vou parar por aqui.
Fiz umas fotos comparativas do ruido da Panasonic FZ5 e da Canon A95.