Interessante a questão.
Vejo da seguinte maneira, fotometria nenhuma é manual, todo e qualquer processo de fotometria é mediado por um instrumento fotomecânico, fotoelétrico ou fotoquímico. Usar o modo "manual" da sua câmera não garante que a fotometria será melhor avaliada que nos modos semi-automáticos (P, TV, AV, etc). Em qualquer um desses modos o importante é saber o que está fazendo, saber usar os modos spot ou matriciais em função da situação e da intenção, de forma consciente. O mesmo acontece com o fotêmetro de mão (externo), simplesmente usá-lo é diferente de saber usá-lo a fim de atingir objetivos específicos na imagem.
Portanto, considero que não devemos ficar "presos" a esse ou aquele meio de fotometrar uma cena, mas devemos estar atentos e saber fazê-lo, em qualquer modo, em função do que é importante diante de cada situação.
Abraços.