Leo;
Vamos a umas perguntinhas básicas:
* Você fotografa com o balanço de branco customizado ou no automático? Porque o balanço de branco diz quanto eu tenho de cada cor R,G e B proporcionalmente para a iluminação na qual a foto foi feita. Ou seja, se eu mudar a proporção entre os canais, eu mudo o balanço de branco.
* Na sua amostra de referência, você sabe quanto você tem de R, G e B?
Ruído, teoricamente não iria te influenciar no resultado a não ser que você faça a amostra da cor (conta-gotas) exatamente no ponto onde está o ruído... aí já era...
Te perguntei estas coisas pois, sob a mesma situação de luz, com o balanço de branco customizado, você passa a ter uma informação de cor conhecida, ou seja, você saberá que a sua referência tem X vermelho, Y azul e Z de verde e com o conta gotas, você terá todos os dados necessário para análise (Hue, saturação, luminância, valor, R, G e B).
Quanto ao excel, esquece, você não tera estas informações de forma ok.
Espero ter ajudado
Jefferson