A posição do flash é super importante em macrofotografia. Com a lente invertida, creio que você está fazendo as fotos quase colado nos objetos. Se a luz não chegar até eles, aí fica difícil mesmo.
Um flash fora da sapata da câmera, com o off-shoe cord, por exemplo, já melhora muito as coisas!
Você segura a câmera com uma mão e o flash com a outra, próximo ao objeto fotografado.