Falar que as duas te servirão maravilhosamente bem, é dizer o óbvio. Vou dar minha opinião sobre o assunto: Se precisa de grandes ampliações ou vai cropar muito as fotos ou pretende ainda utilizar ela como filmadora, a 5DMKII é a pedida. Fora isso a D700 é melhor, em qualidade de imagem em ISOS altos, sistemas de foco com pouca luz, sem falar no sistema de flash. Sobre lentes, as top Nikon são imbatíveis, possuem menos aberrações cromáticas, distorções e são mais nítidas.
Não estou aqui fazendo apologia de marca, não ganho nada pra isso, é apenas minha opinião de comparações próprias. Existem muitos reviews que mostram isso também. Uso Canon e acho a 5D clássica e a 5DMKII (alias quero uma para mim) maravilhosas. Agora como você perguntou qual é melhor, eu acho a Nikon D700.