Não costumo mais falar desse assunto Canon x Nikon, tem material mais do que suficiente na net e aqui no fórum, e normalmente a paixão fala mais alto que a razão, mas vou dar um pitaco.
Primeiro, em qualidade de imagem tanto uma quanto outra são plenamente satisfatórias para qualquer um que esteja iniciando na fotografia com DSLR. Ambas são excelentes cameras, que vem com boas equipadas com boas lentes para uso amador e até nem tão amador assim.
A D5000 tem um ISO alto um pouco melhor, mas a T1i tem mais Mp. Em uma impressão de 20x30 por exemplo, será impossível distinguir o nível de ruído de uma ou de outra, principalmente se as fotos forem feitas em RAW e convertidas adequadamente.
A D5000, como a maioria das cameras Nikon, tem uma pegada melhor e, indiscutivelmente, é mais bonita
Essa questão de robustez eu acho meio folclore. Ambas tem corpo de plástico industrial, nenhuma das duas é vedada, e ambas tem obturador para 100.000 clicks em média. Não vejo onde uma possa ser mais robusta que outra além da aparência e talvez, da lente do kit da Nikon que realmente parece ser mais robusta. Aparência e tamanho não são sinônimo de robustez. Se quer robustez, compre uma 50D ou D300s. E se precisar de robustez mesmo, para fotografar até embaixo da neve, compre uma D3s, uma 7D ou uma 1D.
Meu principal porém em relação à D5000 é a falta de motor de foco no corpo. Uma das primeiras lentes que a maioria dos amadores compra após comprar a camera é uma 50mm clara para poder aproveitar a linguagem fotográfica típica das DSLR, que é o DOF curto. Se comprar a Ti1, vai desembolsar aproximadamente 100 dolares para comprar uma lente assim, a EF 50mm f/1.8. Se comprar a D5000, vai descobrir que a lente Nikon equivalente não faz autofoco no corpo da D5000 e vai ter que desembolsar muito mais para comprar a versão f/1.4 que tem motor de foco. O mesmo ocorre se quiser uma 85mm clara para retratos.
Certo que a Nikon tem uma excelente 35mm f/1.8, mas o DOF de uma 35mm f/1.8 não é equiparável ao DOF de uma 50mm f/1.8.
Alguns outros acessórios também são fáceis de encontrar para a T1i, como o grip por exemplo. Um grip genérico, que melhora enormemente a pegada da camera, além de ser muito prático para fotos verticais, principalmente retratos, custa menos de 50 dólares no ebay e é perfeitamente funcional, com duplicação dos principais botões de comando. Já a D5000 tem apenas um grip genérico que duplica o shutter button e mesmo assim parece que apenas via IR, cabo ou algo assim. Realmente posso estar enganado, se estiver por favor alguém me corrija.
Outro porém é que a Nikon não fornece cópia do seu software de conversão RAW, apenas um trial. Assim, se quiser realmente tirar proveito de tudo o que qualquer uma das cameras tem para oferecer, vai ter que desembolsar para comprar o software da Nikon ou então um software de terceiros. Já a Canon fornece um bom software de conversão gratuitamente.
Tirando estes poréns, como disse antes qualquer uma das cameras irá ser mais do que suficiente. Vá até uma loja, pegue as duas e veja a que mais te agrada. Se o uso será apenas amador, compre qualquer uma sem medo.
Abçs