Que trabalheira... isso me lembra quando eu fiquei procurando por dias aplicativos para melhorar a autonomia do Ubuntu.
Pois então.
Mas infelizmente isso acontece com muitos outros aplicativos.
A Apple colocou uma função interna aonde o OSX decide qual é a placa a ser utilizada e não colocou (pelo menos ainda) nenhuma possibilidade do criador do software determinar que aquele aplicativo deve usar prioritariamente uma ou outra placa.
Eu me dei bem assim. Essa necessidade é somente para os MacBooks Pro mais recentes, a linha que foi lançada no final de 2010. Todos os outros não necessitam pois os poucos que possuem duas placas de vídeo possuem a opção de seleção de uma ou outra a área de gerenciamento de energia.