Há duas formas básicas de se fazer isso: com uma pasta monitorada ou capturando as imagens diretamente pelo LR 3.
Eu uso pasta monitorada para trabalhar com o cartão Eye-fi.
Você tem que criar uma pasta monitorada pelo LR 3.
Arquivo -> Importação Automática -> Configurações de importação automática... (escolha uma pasta monitorada)
Então basta iniciar a captura automática.
Arquivo -> Importação Automática -> Ativar captura automática.
Caso você use a câmera conectada diretamente ao micro, basta usar o:
Arquivo -> Captura vinculada -> Iniciar captura vinculada... (escolha o destino).