Bem, na sua camera vc está vendo um JPG processado de acordo com a configuração da sua camera.
No Lightroom vc está vendo o RAW processado de acordo com as configurações do LR.
Experimente colocar a camera no modo monocromático e faça uma foto em RAW. No visor da camera, vc verá ela preto e branco porque essa é sua configuração, no LR verá ela colorida.
A única maneira de ter um RAW pré-processado de forma idêntica aquilo que vc vê na camera é usando o conversor RAW do próprio fabricante da camera que lê a configuração dos metatados do RAW e já a aplica por default. No seu caso, o CaptureNX 2.