São câmeras de grupos característicos diferentes. Tamanho de sensor, qualidade de imagem, preço, construção.
É como comparar um Classe A com uma 500S (estou colocando duas Mercedes, para não ter aquela de que um é mercedese outro não). São câmeras de custo e resultados distintos.
As full frame tem um sensor muito maior, por isso fazem fotos em pouca luz com melhor qualidade. Aceitam iso mais alto. O corpo é lacrado, nas DX não são todas, algumas lentes também (mas não todas). As lentes em geral tem melhor construção, são mais claras e nítidas. Em compensação, o preço das lentes é, em geral, muito maior.
Por exemplo, comprei uma D7000 + 2 lentes (18-105VR e 70-300VR) + 1 flash (SB700) + mochila + tripé (5,5kg de carga Vanguard) + RC + 2 cartões classe 10 de 16Gb + Filtros ND, Polarizador e 2UV Hoya + bateria extra + carregador + frete por 2500 dólares. O preço de um corpo D700 e um pouco mais barato que o corpo da 5DMKII.