Esse problema é mais frequento do que vc imagina. Mas cada um tem suas particularidades.
Ja tive esse mesmo problema em um 430EX-II.
No meu caso, ao inves de aparecer E-TTL, no flash aparecia TTL, e ele disparava em Carga Máxima.
Porem eu conseguia disparar em Manual em qualquer carga.
Pesquisei bastante na internet e vi que podia ser vários problemas:
Defeito na Sapata da camera (esse foi o meu caso).
Sujeira nos contatos do flash com a sapata.
Defeito no flash mesmo.
Defeito na lente, pois para fazer o E-TTL o flash precisa de informações da lente.
Pelo o que vc relatou, creio que seu defeito seja no flash mesmo, ja que vc nao consegue controlar nem a carga dele em modo Manual.
Acho melhor vc leva-lo em uma assistencia tecnica de confiança.