Quando você usa a câmera no manual, a abertura e a velocidade não vão mudar mesmo, se você usar o flash em TTL ele vai fazer a fotometria e toda a luz que faltar ele vai compensar para a foto sair com exposição correta(em 0) ou a que você setar também no modo manual(-1, +1, etc) lembrando que você tem que decidir qual tipo de medição utilizar também, pontual, matricial, etc...