Eu tenho as duas.
A diferença é gritante em 2 aspectos:
Velocidade,precisão e opções de customização de AF (além de um número considerável de pontos de AF usáveis)
Velocidade de disparo e número de disparos seguidos.
Existe ainda uma boa diferença na qualidade da imagem: a mark III tem menos noise em ISOs altíssimos (notável principalmente de 3.200 para cima).
A mark III pode gravar simultaneamente em 2 cards, ou seja, backup instantâneo.
A mark III tem algumas perfumarias e detalhes interessantes: travinha no seletor de modos de disparos, disparo silencioso, possibilidade de classificar fotos já na câmera, alguns modos de compressão de vídeo diferentes, etc
Mas a mark II é uma ótima câmera. Acho que o único defeito dela é o AF horrível, lento e pouco preciso (e só com o ponto central usável). E ela é um pouco lenta no geral.
abraços,
Vini