Eu fiz um vídeo do celular do que está acontecendo e postei no youtube pra galera ver se estou fazendo algo errado (ou deixando de fazer).
Lembrando que, com outros vídeos de tamanho menor eu faço exatamente como mostro nesse vídeo:
http://www.youtube.com/watch?v=SLy3VpGtQx0&feature=youtu.be
Deem uma olhada por favor!!!
Tá Volks, antes de mais nada vocÊ precisa entender com o que está lidando, senão você fica como está baixando um monte de programas que não vão solucionar seu problema. Assim como fotografia, a informática também tem suas técnicas e advinhar não é um bom caminho.
Primeiro de tudo, vocÊ tem que entender o que é o .mov que você quer converter. Ele é um container, uma embalagem que traz um arquivo dentro, uma informação codificada, no caso, as informações para montar um vídeo.
Dentro de uma container pode ter uma informação em mais de um formato. Formato é a lingua, o código usado para guardar a informação.
Quem entende esse código? O Format Factory, o VLC? Não, tem um programinha que entende o código e traduz para todos esses programas. Quando o Format Factory pega um formato ele entrega para o programa que entende desse código e recebe dele a tradução. O nome desse tipo de programa é codec. Tem um codec para cada format, mp3, mp4, avi, wmv etc etc. O que está acontecendo é que você não está com o codec que entende seus arquivos, ou melhor, entender porque esse codec que vocÊ está usando é para um formato guardado em container MOV, mas não para o formato que você quer.
Muitas vezes você usa um codec errado, mas para um formato parecido e ele acaba conseguindo alguma coisa, coisas tais como o cara ouve o som, mas não vê a imagem, ou o contrário, ou ele converte alguns arquivos outros não.
Suponho que você tenha instalado o codec que eu te falei. Então agora vá no format Factory e selecione opções e avançado, depois clique em instalar. Depois de instalar os codecs padrão do FF, tente novamente. Se não der certo desinstale todos os pacotes de codecs, dê um boot na máquina instale novamente os codecs. Aí a coisa pode variar, tenta primeiro o da câmera, depois tira e tenta o k-lite, depois tira e tenta o cccp.
É chato mesmo, mas melhor que formatar o computador.