A 5D II só tem o ponto de foco central cruzado. Além disso, os 9 pontos de AF são mais concentrados no meio do quadro. Além dos 9 pontos visíveis, a 5D II tem mais 6 pontos auxiliares invisíveis, que você pode ativar ou desativar quando quiser. Parece que só é útil pra quando se usa o AI Servo. Além disso, o ponto de AF central de ambas as câmeras é mais sensível se usar objetivas de abertura máxima f/2.8 ou mais abertas.
Apesar dessa aparente inferioridade, eu tenho achado o AF da 5D II mais rápido preciso do que o da 60D e 7D. Pelo menos a impressão que eu tenho é de que perco bem menos fotos hoje com a 5D II do que com a 7D ou a 60D.