O Mogrify é um programa que faz parte do pacote do ImageMagik. Na realidade o que o plugin LR/Mogrify faz é implantar uma interface que chama o mogrify em background, ele por si só funciona apenas via linha de comando. Até parece que estavam desenvolvendo uma GUI para o ImageMagik, mas não sei se saiu.
Usar o mogrify via linha de comando é bem simples para a maioria das operações, e as vezes mais prático do que em ambiente gráfico, já que com um único comando vc pode processar centenas ou milhares de fotos de uma só vez e com uma velocidade alucinante. Tem algumas coisas que prefiro fazer via linha de comando mesmo, estes dias descobri como usar os log's gerados pelo GPS do celular para fazer geotagging das fotos usando o exiftool que tem por padrão em todas as distribuições linux, tudo via linha de comando. E é uma barbada.