Eu acredito piamente que o grande culpado disso é o banco. O resto é consequência do mal-entendido.
O banco do brasil (com minúsculas mesmo) é um lixo e não é de hoje. Tive vários problemas enquanto fui correntista deste (péssimo) banco e conheço muita gente que tem problemas até hoje.
O Alex fez um depósito e tem prova disso (o comprovante), ou seja, o banco recebeu o dinheiro. O Rafael não recebeu o dinheiro e tem prova disso (o extrato bancário onde não consta o tal depósito), ou seja, o banco não repassou o dinheiro. Quem efetivamente pegou o dinheiro e deu sumiço foi o banco. Ponto final. O que o gerente ou qualquer outro funcionário diz, infelizmente, não tem muito valor. Informação errada por parte dos funcionários é o que mais ocorre dentro das agências deste lixo. Se não for por escrito, não há garantias de nada. Não tem cabimento chegar em uma agência com um documento oficial do próprio banco e um gerente simplesmente dizer que não consta o depósito e não pode fazer nada. O banco tem que prestar contas deste dinheiro SIM.
Agora, na situação atual, a única pessoa que pode resolver isso é o Rafael (tia dele). Entendo que ele esteja muito chateado com o rumo que as coisas tomaram mas ele é quem tem que cobrar do seu gerente este depósito. Ainda mais tendo o comprovante em mãos.