Tsouto,
Venho acompanhando seus posts e estava aguardando a minha 6d chegar. Minha irmã trouxe dos EUA, comprou na BH com o kit 24-105 e eu ja tinha a 50 mm f/1.4, então to com um arsenal bem legal.
Eu andei testando a performance dela em ISO alto também e resolvi te perguntar. Pelo que entendi vc está usando raw e dando uma tratada de leve no LR. Agora o que não ficou claro pra mim é qual a configuração voce colocou o NR (noise reduction), existem 4 possibilidades pra JPEG (off, low, standard, high e NR) e 3 pra RAW ( só nao tem o NR). Se voce estiver usando o NR no off realmente ta surpreendente, pois em RAW, ISO 10000 com o NR no off a minha apresenta um ruido bem perceptivel.
Pelas minhas avaliações o NR limpa muito mais o ruido em JPEG do que em RAW sem perder muitos detalhes. Fiz uns testes aqui e vou tentar postar pra turma ver.