Rafa, como você está avaliando a nitidez? Uma coisa que sinto é que, quanto maior o sensor, menor a "tolerância" com pequenas tremidas e coisas do tipo. Senti isso quando peguei minha primeira DSLR, e senti isso novamente quando saí de APS-C e fui para FF. Mas esse tipo de falta de nitidez só se percebe em aumentos de 100% ou próximos disso.
Tente usar velocidades mais altas para ver se melhora, sem VR mesmo, daí vai saber se é esse o problema ou não. E, se for, tente investir em uma técnica mais firme para fotografar, que te dê mais estabilidade.
No mais, pode também ser apenas resultado do tratamento da foto, o JPEG de uma compacta já vem mais "pronto", talvez seja o caso apenas de investir mais na conversão do RAW para melhorar os resultados.
E evite comparações em aumento 100% ou muito grandes. Pense no tamanho final, seja impressão ou visualização na tela, esse é o melhor jeito de avaliar nitidez.
Abraços