Sivio, no geral o LR é um programa bem mais completo que o DPP da Canon, tem muito mais recursos, principalmente para armazenar e catalogar os arquivos, o LR tem muitos recursos nessa parte (o DPP é apenas para conversão do RAW). Mas acho que é justamente essa simplicidade que me atrai no DPP da Canon, tudo fica mais fácil pra mim, que já estou acostumado com o programa.
Além disso, tem vários testes por aí pela rede mostrando que os resultados da conversão do RAW pelo DPP é superior aos do LR. Nos meus próprios testes percebi isso, mas pode ser apenas minha falta de familiaridade com o LR...
Outra coisa que gosto é que o DPP importa todos os parâmetros que você usou no seu Picture Style, automaticamente. Assim, eu já deixo alguns ajustes pré-configurados na câmera, que já são importados para todas as fotos. Não é um ganho absurdo de tempo, porque eu trato as fotos uma a uma de qualquer forma, mas já é alguma coisa.
Enfim, acho que é mesmo uma questão de gosto pessoal, eu acabei me acostumando com o DPP e faço tudo por lá, é basicamente o único programa que uso para tratar as fotos.
Abraços
Espaço Canon