Não manjo muito, mas pelas minhas porcas tentativas de still, vejo que f/16 ainda não dá muita profundidade de campo. Ainda mais para coisas pequenas, quando se tem que chegar muito perto.
Por exemplo, uma que tentei esses dias: sensor FF, f/22, 90mm. Dá pra ver que, mesmo em f/22, já começou a desfocar ali no dial de velocidade. O foco fica bem raso mesmo, pois o objeto está bem perto.

Podia tentar uma lente mais aberta, mas daí a câmera ficaria meio distorcida e não sei se a lente conseguiria focar. Acho que não respeitaria a distância mínima de foco.
Egon, não tenho facebook. Posta aqui pra gente ver.

Pelo que entendi, você monta uma "cena" grande com várias miniaturas, é isso mesmo? Ou é só uma miniatura? Acho que não tem muito jeito, talvez você tenha que usar tilt shift ou focus stacking. (ressalto que ainda não entendi bem o problema)