Oi Fabiane
Também não sou um mestre em fotografia, mas vamos lá:
1) Um pequeno ponto de fungo nas lente, não costuma causar problemas na qualidade da fotografia. Normalmente estes fungos se desenvolvem em lentes guardadas por muito tempo, em local escuro e sujeito a alguma umidade. Se você puser o gel para manter seca a lente, provavelmente limitará os fungos ao único pequeno foco que tu mencionou.
Considere ainda que estes fungos não gostam nada de luz. O simples fato de usar a lente as vezes em ambientes ensolarados providenciará o final da colônia, visto que a radiação ultravioleta possui efeito adverso sobre o foco de fungos. Em ultima instância, se porventura estiver atrapalhando ou houver mais alguma pequena expansão na área afetada pelos fungos, você deverá providenciar a limpeza da lente. Se este serviço for de fácil acesso a você, pode mandar fazer logo e já resolve o problema.
Quanto a fotografias noturnas com luz ambiente, eu também faço e tenho boas noticias: Com um tripé ou um apoio confiável você obterá belas e interessantes fotografias, usando ISO baixo e exposição de tempo de alguns segundos. A melhor noticia é que fotos à noite permitem ampla margem de erro ou se preferir, latitude de exposição , em outras palavras , enquanto em uma foto diurna uma fração de segundo a mais pode esculhambar a fotografia, nas fotos noturnas um ou dois segundos de diferença mal podem ser percebidos, mesmo porque quem vê a fotografia depois não sabe qual a luminosidade real da cena. Aproveite para usar um tripé e fazer fotos com diversas opções de tempo x abertura, mantendo o ISO até no máximo uns 800 para ter baixo ruído nas fotos. Particularmente eu prefiro ISO até 200 ou 400 sempre que possível.
Para finalizar, você deve usar lentes com motor de foco e com VR, como o colega disse.
Abraço
PMVG