Geralmente igrejas têm paredes claras e não tão distantes. Experimente rebater o flash nas paredes, e não apenas no teto. Eu fiz meu 1° batizado semana passada e usei flash (rebatido) na maioria das fotos. Evite o flash direto, além de ser feio, incomoda demais os bebês. Se for muito novinho, dizem que pode até causar problemas na vista.
O difusor pro flash só vai servir se tiver onde rebater, essa é a função do difusor. Ele espalha a luz pra que ela rebata nas paredes e teto. Mas se tem lugar pra rebater, eu prefiro mandar o flash direto pra parede sem difusor, a luz fica mais direcional, mais bacana. Vale a pena dar uma estudada e praticada nisso, ao invés de se limitar a rebater apenas no teto.