Prefiro o Aperture, mas isso é gosto e costume pessoal. Trabalhei anos com os programas da Adobe (acredite, tenho várias licenças) mas não uso mais nada dela. Os programas são pesados e o ACR é ruim.
No caso de um micro com pouco HD, configure na hora de importar os arquivos, para deixar os originais no local de origem, tipo o HD externo. O Aperture, como todo programa organizador, cria um banco de dados referenciando as fotos. Para cada modificação feita, é criado um conjunto de instruções como que foi feito que pode ser na forma de um XML por exemplo, ou um outro formato qualquer. É através destas instuções que você cria as versões, que podem ser exportadas depois para onde você quiser.
Mantendo os arquivos fora da biblioteca, o aperture fica MUITO rápido e leve. Agora se enfiar 50000 fotos com 20 versoes cada, ai a lib cresce para sei lá, 400 Gigas... Aí ja viu.
Arquivos dentro da lib tem sua utilidade, mas em geral não é o mais adequado.
Esta semana mesmo eu limpei um Mac de uma amiga que tinha 55000 fotos de viagem DENTRO da lib. E o pior é que estava bem fluido. Só que com tudo quadruplicado, pqp...
Uma boa alternativa é usar um organizador específico, como o PhaseOne Media Pro que é disparado o mais parrudo. E vocÊ usa o programa que quiser para ajuste de imagem, seja o Aperture, LR, PS, PSE, DxO e por aí vai. Tem também o COrel Aftershot Pro que a última versão está fantástica.