A 5D MK II, durante o vídeo, não aceita AI Servo. E digo mais, o AF em video é muito ruim, o melhor é fazer no manual mesmo. Então não tem jeito, se vc quer acompanhar um objeto tem que fazer como cameraman profissional: vai alterando o foco.
A foto, durante o video, é como se fizesse um freeze frame, vc não tem como opção um Servo.
Espero ter ajudado.