Câmeras de segmentos diferentes e não cabe comparação entre elas. A S90 (ou S95, sua sucessora) é uma compacta que possui controles manuais e sensor maior que o normal gerando maior qualidade de imagem, a S9100 é uma compacta superzoom automática, não há controle praticamente nenhum sobre as fotos, é apontar e clicar mas possui um grande alcance.
Basta definir suas prioridades: Se procura maior qualidade de imagem e controle sobre o que vai ser fotografado, é S90. Se quer apenas longo alcance e nada mais, é S9100.