Olhos vermelhos existem muitas ferramentas que podem resolver isso, no próprio Ps tem uma razoável, no seu caso é necessária uma ferramente rápida por causa do volume de fotos.
O correto mesmo é fazer manualmente, mas dá muito trabalho.
Com relação a sombra use o comando shadows/Hightlights do PS, não fica perfeito mas ajuda, o certo mesmo é tentar usar flash rebatido para evitar sombras.