Pessoal, dei uma lida rápida no tópico e vou dar meus 2 cents..
Primeiro em relação ao foco por contraste ou fase.
O foco por fase é feito por um sensor separado e precisa que um dezenas de pequenas variáveis estejam corretamente acertadas para funcionar bem. A lente tem que estar calibrada, jogando o plano focal no local correto, o ângulo do espelho quando em repouso tem que estar correto para que a luz desviada para o sensor de foco chegue em ângulo e posição também correta, o sensor de foco tem que estar calibrado corretamente. O que o sensor de foco analisa não é a imagem formada sobre um sensor, mas uma pequena parte dela que é desviada, dividida em fases e analisada. Qualquer uma dessas variáveis estando descalibradas e teremos front ou back-focus.
As rotinas de microajuste de foco existente nas câmeras da parte de cima da pirâmide são rotinas para compensação destas calibrações errôneas. O mais comum é a lente ter algum erro de calibração, e neste caso a rotina de microajuste pode corrigir, principalmente lentes prime. Se a câmera não tem rotina de microajuste, então a lente tem que ser levada a um técnico para ver se não existem problemas de calibração ou colimação (quando os raios de luz não chegam ao sensor perfeitamente paralelos). Até mesmo para as câmeras com microajuste, as vezes este se mostra ineficiente para lentes zoom. Vc acerta em uma DF, mas em outra DF continua com problema.
Em outro caso, quando existem erro de foco por fase em todas as lentes, o mais comum é que o ângulo de repouso do espelho esteja incorreto. Muitas câmeras tem um parafuso ao lado do espelho que regula essa posição, mas este só deve ser mexido por um técnico capacitado, caso contrário vc pode ferrar o autofoco de tal forma que nunca mais vai conseguir regular
Por curiosidade, aqui tem um tutorial de como fazer isso. Mas o Ministério da Fotografia adverte, não tente fazer isso em casa
http://www.google.com/translate?u=http%3A%2F%2Fwww.astrosurf.org%2Fbuil%2Fautofocus%2Fadjust.htm&langpair=fr|en&hl=en&ie=UTF8
Já o foto por contraste é feito pelo próprio sensor através da análise de contraste da imagem gerada. A grosso modo, a lente vai para frente e para trás e algoritmos vão analisando a imagem na área de foco até que se chega a um ponto de constraste máximo. Esse ponto de contraste máximo equivale ao melhor foco possível. Portanto, para foco por contraste não existe back ou front focus, o foco será sempre o mais preciso possível.
Por isso que muitas vezes o foco via viewfinder não fica cravado, mas via liveview fica.
Quanto às cores, não vejo porquê ficariam diferentes, já que apenas o processo de foco se altera, mas o de captura não. Será que não tem algo a ver com o WB automático ????