Na Nex você pode usar as lentes nativas e-mount da sony, hoje em dia tem lentes de outras marcas (sigma) para e-mount.
Lentes da sony alpha (a mount) funcionam com adaptador próprio e mantem o foco automático (dizem que o foco fica bem rápido).
Com o adaptador certo, usa quase todas as lentes manuais antigas, com vantagem de ter focus peaking para auxiliar no foco manual.
Tem que ver o custo do corpo, o custo das lentes nativas, a qualidade das lentes nativas e qual tem melhor "pegada" para você.
Apesar de ter citado as vantagens da nex, foi só para dar uma outra visão diferente dos colegas, eu escolhi o sistema m4/3, principalmente pela portabilidade do conjunto corpo + lente (na nex fica um pouco mais desproporcional), mas isto também é subjetivo.