Se ambas tem o mesmo sensor, 99,9% da diferença da qualidade de imagem, se ambas tiverem raw será ditada pela lente.
Se for jpeg, a qualidade do algoritmo de conversão do raw interno para jpeg, irá influenciar, e muito. O que isso quer dizer ? É que algoritmos mais sofisticados levam mais tempo para ser executados, e a velocidade do processador faz diferença. Em geral, quando usado um processador muito lento, o algoritmo de conversão é mais simplificado para a conversão não demorar demais.
As principais diferenças dos processadores estão no processamento de vídeo e live view, muito pouca coisa varia para uma imagem still.