Oi Lourenço,
pela posição - altura - do flash a sombra ao invés de ir reto para o fundo, tem um ângulo para baixo, o que, se por um lado fica mais natural pois esperamos sempre que a luz venha de cima, por outro marca mais as pessoas com orelhas protuberantes... Hmmm... Isso não é culpa do flash...
A sugestão do Paulo é válida, vai jogar a sombra para o lado.
Outra, desde que o flash permita, é girar sua cabeça para um dos lados ou mesmo para cima, usando o teto como rebatedor.
Coloque as pessoas em um ângulo mínimo, não totalmente de frente.
Por último, evite tirar fotos de pessoas muito próximas de uma parede. Sei que nem sempre é possível, mas tenha isso em mente também.
Boa sorte, abraços,
José Azevedo